危機總動員

某種伊波拉病毒（劇中改為莫塔巴病毒）於1967年在剛果共和國的叢林被發現，兩名發現的士兵為了保密將其村落炸毀。1995年，病毒於薩伊再度被發現，美國陸軍傳染病醫學研究院的病毒學家山姆丹尼爾上校（達斯汀霍夫曼）被送往該地進行調查。他和他的小組成員凱西舒勒少校（凱文史貝西）以及另一名年輕沙特少校（小古巴古汀）獲得病毒相關資訊後便返回美國通知比利·福特准將（摩根費里曼）發布警報，福特知道此種病毒並告知丹尼爾這種病毒不太可能會爆發疫情。同一時間，一隻名叫貝琪的白面僧帽猴為病毒宿主被非法引進美國。實驗動物中心的員工詹姆士·金寶史考特將貝琪偷走後帶到加州錫達河黑市進行買賣，運送途中金寶已遭到感染。

金寶嘗試將貝琪賣給寵物店導致店長魯迪被貝琪抓傷也遭到感染，貝琪因而被釋放到森林裡。金寶在飛回波士頓的途中感染跡象已開始顯現，當他一下飛機親吻了女友艾莉絲後進而將病毒傳染給她。丹尼爾的前妻羅比基奧（蕾妮羅素）為疾控中心的科學家開始著手進行調查感染病源，她發現金寶、艾莉絲和魯迪皆死於病毒感染，但波士頓內卻沒有半個人遭受到病毒感染。期間，錫達河醫院的檢驗師在檢驗魯迪的血時意外打破血液瓶並被魯迪的血液噴濺到並感染喪命，病毒在此時演化成一種新病種並可藉由空氣傳播感染，錫達河醫院的眾多病患及工作人員皆暴露於感染環境中。丹尼爾得知此事後便瞞著將軍帶著他的小組前往錫達河與羅比一同對抗病毒。

在丹尼爾他們搜尋宿主時，美國軍隊進駐了錫達河便頒布新法令告知任何居民皆不得離開鎮上。搜尋期間，凱西因防護裝破裂而意外遭受感染，羅比在凱西開始抽蓄後便為他注射被用在解救感染伊波拉病毒的血清E-1101意外地讓他病情暫時穩定下來。此時丹尼爾很快地意識到這個血清並不是實驗品而是用來治療感染伊波拉病毒的人且福特准將也知道此事。然而，此血清對於感染了變種型病毒的錫達河居民無效。在丹尼爾的逼問下福特准將才承認當初會隱暪此事是由於美軍有意將伊波拉病毒拿來製作成生化武器，他進而得知美國總統有意轟炸錫達河鎮，此方法則是福特的夥伴唐尼·麥克林托克少將於1967年用來轟炸難民營以銷毀及掩蓋病毒存在的方法。為了防止此事發生丹尼爾開始尋找治療方法，最後他在運載宿主動物的船上發現了貝琪的照片並散布此消息。傑弗里斯太太看到此則消息時發現這隻就是與女兒凱特在後院遊玩的猴子，她急忙通知軍方此事而福特最後便取消轟炸。丹尼爾和沙特在搭乘直升機返回的途中得知麥克林托克少將仍執意要執行轟炸便從中阻攔，最終炸彈掉落水中引爆而麥克林托克則遭到逮捕。丹尼爾與沙特從宿主身上調配出解藥進而解救小鎮上的居民。

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